保健品企业按实力不同，各自的组织结构也不一样，大致分为以下三种但随时也有结构软肋：

一是自建营销队伍。一般是先在企业总部成立一个营销中心，再层层增加下设分支机构，如省级子公司、地市级分公司，甚至县级分公司、乡镇办事处。这样的企业一般对自己的产品特别有信心，也有一定的实力。自建队伍可以很好地掌控渠道和终端，执行力强，但前期投入非常大，人力成本高，营销队伍的维护费用也很大。一旦市场业绩不够好，营销队伍很容易解体。

二是通过打招商广告建立营销网络。这些企业通常在专业媒体上大打招商广告，找到合适的经销商和代理商就快速切入市场，并通过针对他们的培训和活动推动产品推广。这种模式营销费用低(主要用于招商媒体和网站、药交会的广告宣传)，投入较小，资金回笼快，企业的风险基本转嫁到经销商和代理商身上，但企业对市场的掌控能力比较差，销售难以上量，利润空间较薄，而且经销商和代理商的忠诚度不高，产品随时可能被替代。

三是通过直面消费者形成利用消费者数据库的电子商务销售模式，这也是医药保健品今后的销售方向。运作这种模式的企业手上拥有很好的媒体资源，和上游生产企业关系很好，一般在省级市场设立面向消费者的会员中心，并经常组织以消费者为主体的营销活动。这种模式跳过了渠道、终端等中间环节直接面对消费者，利润空间较大，但必须保持和媒体的良好关系，否则要以较合适的价位拿到好的广告位难度较大，建设和培养一支专业的咨询医生和客服队伍的投入也很大，企业要有持续投入的决心和胆量，当然物流配送成本居高不下也是这些电子商务公司的软肋。